Как и планировалось, сегодня в 07:45:05 по московскому времени с пусковой установки № 6 площадки № 31 космодрома Байконур выполнен успешный пуск ракеты-носителя «Союз-2.1а» с транспортным грузовым кораблём «Прогресс МС-16». Уже через 8 минут 48 секунд зафиксировано штатное отделение корабля от третьей ступени носителя, после чего были раскрыты солнечные батареи и антенны. Перед пуском в 03:40 по московскому времени прошло заседание Государственной комиссии по вопросам готовности к проведению заправки и пуска. Члены комиссии приняли решение о готовности ракеты, и в 04:10 стартовые расчёты приступили к заправке. Окончание данной операции, отстыковка заправочных шлангов от ракеты и эвакуация заправочных агрегатов с «нулевой» отметки произошли примерно в 06:15.